44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2789 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2789  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  21.67 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  22.6 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 385 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  26.02 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0361  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.843248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  23.92 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 441 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  26.13 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  26.53 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  23.74 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  22.71 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 441 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  24.19 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  25.63 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  24.61 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  23.27 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  23.98 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  22.46 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  21.43 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  26 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  25.9 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 197 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>