26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0981 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 441 aa  910    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  43.44 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  41.96 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  38.6 
 
 		 441 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 		 201 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  24.21 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 216 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  26.4 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  26.18 
 
 		 208 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 197 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  24.62 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2789  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 234 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  24.62 
 
 		 195 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  25.48 
 
 		 225 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  27.46 
 
 		 212 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 		 197 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  22.87 
 
 		 201 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 198 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  23.76 
 
 		 219 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  27.27 
 
 		 199 aa  43.5  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 197 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>