12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2425 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 436 aa  904    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  41.96 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  40.05 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  35.74 
 
 		 385 aa  183  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 215 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  23.62 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 198 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>