38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1673 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1673  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2676  DSBA oxidoreductase  61.03 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  53.52 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  52.58 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1203  DSBA oxidoreductase  53.24 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1112  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 435 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 		 385 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  21.05 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  28.17 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0981  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 		 441 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00950  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  25.47 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  24.15 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  23.18 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2425  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.37 
 
 		 436 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.35643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  22.6 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  24.64 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  27.19 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5538  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 		 441 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0197902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  23.29 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  24.54 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  25.23 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2789  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  20.81 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  24.09 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>