149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3711 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 195 aa  408  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  49.74 
 
 		 195 aa  208  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 204 aa  207  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  49.49 
 
 		 204 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  50.51 
 
 		 196 aa  206  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  49.22 
 
 		 195 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  52.04 
 
 		 197 aa  204  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  48.98 
 
 		 197 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  49.49 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  48.98 
 
 		 204 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  49.24 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  44.67 
 
 		 196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  42.93 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  41.54 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  43.39 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  42.11 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  41.54 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  41.8 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  40.53 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  40.91 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 		 200 aa  141  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  37.89 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  37.37 
 
 		 210 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  38.78 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  34.24 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  34.05 
 
 		 212 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  38 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  33.16 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  31.12 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  28.65 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  28.28 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 208 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  29.79 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 208 aa  92  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 208 aa  92  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  27.69 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 232 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  32.52 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  29.84 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  28.88 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  26.52 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  27.22 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  23.78 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  29.74 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  26.63 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  22.7 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>