192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1944 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 200 aa  396  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  48.21 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  43.88 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  43.22 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  43.72 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  43.72 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  45.41 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  43.43 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  43.15 
 
 		 218 aa  153  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  42.93 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  36.17 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  35.71 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  39.47 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  37.7 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  35.2 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  36.55 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 197 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  31.34 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  33.83 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  37.06 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  31.5 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 		 218 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  34.98 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  31.86 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  30.3 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  29 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  32.66 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  27.5 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03849  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07870)  25.87 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.728654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  27.32 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  26 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>