169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0193 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  96.41 
 
 
195 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  60.51 
 
 
196 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  59.39 
 
 
197 aa  236  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  58.46 
 
 
204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  58.16 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  58.46 
 
 
204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  60 
 
 
197 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  59.49 
 
 
196 aa  230  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  58.97 
 
 
197 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  55.84 
 
 
200 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  58.97 
 
 
197 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  57.44 
 
 
204 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  49.74 
 
 
195 aa  208  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  42.41 
 
 
203 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  42.5 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  40.31 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  41.03 
 
 
201 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  41.62 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  38.89 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 
200 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 
201 aa  144  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  40.31 
 
 
200 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  40.84 
 
 
200 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 
213 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  40.72 
 
 
200 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  39 
 
 
210 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  38.78 
 
 
203 aa  141  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  38.07 
 
 
200 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  39.2 
 
 
206 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  38.19 
 
 
206 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  37.76 
 
 
200 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  39.09 
 
 
218 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
207 aa  134  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  37.95 
 
 
201 aa  131  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 
206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  35.08 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  37.1 
 
 
212 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  39.57 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  36.56 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  37.3 
 
 
202 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  37.43 
 
 
208 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 
201 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  37.69 
 
 
199 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  35.2 
 
 
201 aa  111  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
208 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
208 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  35.18 
 
 
204 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 
197 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  37.43 
 
 
208 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  32.81 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 
219 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 
219 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  34.21 
 
 
201 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 
223 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 
200 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
201 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 
201 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  36.27 
 
 
202 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 
195 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 
208 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
232 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  32.81 
 
 
199 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  34 
 
 
199 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  34.95 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
232 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  30.85 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  31 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  34 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
214 aa  91.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  33 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  33.83 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 
199 aa  87.8  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 
197 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
212 aa  84.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 
210 aa  84.3  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  31.66 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>