164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2829 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  82.09 
 
 		 201 aa  346  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  59.9 
 
 		 201 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  58.29 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  56.93 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  56.06 
 
 		 199 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  48.76 
 
 		 209 aa  188  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  45.27 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  46.77 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  44.44 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  42.71 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  46.46 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  43.94 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  47.47 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  44.28 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  43.43 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  43.28 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  47.62 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  42.29 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  45.32 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  41.5 
 
 		 216 aa  150  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  44.5 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  43 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  35.86 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  31.84 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  34.67 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 204 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  33.67 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  31.66 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2478  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  26.5 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  32.85 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  25.89 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  27.46 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2300  DSBA oxidoreductase  27.05 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.609193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  28.42 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2081  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 		 385 aa  62  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>