104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4964 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4964  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  438  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  36.56 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  39.78 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  39.33 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  36.56 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  41.24 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  41.94 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  40.82 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  34.41 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  41.57 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  36.96 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  36.96 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  57.5 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  37.89 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  40.66 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  45.24 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  45.45 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.7 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.7 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.78 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.7 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.7 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  34.78 
 
 		 723 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  33.7 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  33.7 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0222  DSBA oxidoreductase  55.56 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  52.27 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  38.71 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  35.79 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  35.79 
 
 		 195 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  35.79 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2241  putative 2-hydroxychromene-2- carboxylate isomerase family protein  52.63 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  34.38 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  41.1 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  42.86 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  42.65 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  32.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  52.5 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  41.1 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  30.68 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  52.5 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0716  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0733  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  40.48 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  40.48 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0744  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  46.34 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  32.56 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  36.17 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2418  DSBA oxidoreductase  35.11 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1390  DSBA oxidoreductase  42.11 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00141956  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  47.37 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  29.55 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  38.78 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0608  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  41.82 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  33.67 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  39.08 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0168  DSBA oxidoreductase  36.46 
 
 		 385 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0353  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0837  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0809  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0083  DSBA oxidoreductase  47.37 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0411784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  39.58 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  33.7 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  37.1 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 		 201 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 212 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>