116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0716 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0716  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759492  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0733  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3929  DSBA oxidoreductase  91.04 
 
 		 212 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559828  normal  0.0117415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  90.57 
 
 		 212 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0353  DSBA oxidoreductase  91.98 
 
 		 212 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0837  DSBA oxidoreductase  91.98 
 
 		 212 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0809  DSBA oxidoreductase  91.51 
 
 		 212 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  71.9 
 
 		 723 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  71.9 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  71.9 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  71.9 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  71.9 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  71.9 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  71.9 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  70.48 
 
 		 212 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2418  DSBA oxidoreductase  71.43 
 
 		 214 aa  314  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  69.81 
 
 		 216 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  68.1 
 
 		 216 aa  295  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  54.73 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  54.73 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  55 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  54.5 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  53.5 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  53.5 
 
 		 212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  52.5 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  52.97 
 
 		 211 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  52.97 
 
 		 211 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  37.88 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0747  DSBA oxidoreductase  37 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.340191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  33.66 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  27.66 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  26.6 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  26.18 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  26.6 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  25.53 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  26.02 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  24.61 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  28.29 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  25.54 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  25.96 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  23.74 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  23.23 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  25.4 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  27.66 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  25.4 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4964  hypothetical protein  35.23 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  25.27 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4651  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1326  DSBA oxidoreductase  26.84 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  22.11 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  26.83 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>