78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3790 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  100 
 
 		 399 aa  813    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  28.13 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  29.08 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  31.23 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  29.18 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  28.37 
 
 		 435 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  28.37 
 
 		 435 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  27.81 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  27.81 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  25.08 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  28.38 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  29.63 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  24.47 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  26.18 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  26.18 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  26.18 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  26.39 
 
 		 438 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  26.42 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  25.32 
 
 		 438 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  26.42 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  26.4 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  25.57 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  28.45 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  28.46 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  28.46 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  25.78 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  27.45 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  28.11 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  27.45 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  28.11 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  28.11 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  27.71 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  27.71 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  27.56 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  26.67 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  26.67 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  26.91 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  26.91 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  26.91 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  26.91 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  26.91 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  27.31 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  25 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  31.58 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  23.29 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  19.89 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  26.58 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  26.38 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  40.96 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  40.96 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  26.2 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  27.32 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  25.66 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  23.02 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  29.71 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  22.86 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  31.03 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  32.26 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  32.53 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  31.52 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  20.17 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  31.91 
 
 		 230 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  25.25 
 
 		 233 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p09  hypothetical protein  32.98 
 
 		 297 aa  50.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  23.21 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3324  hypothetical protein  23.11 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.709661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  23.5 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  33.72 
 
 		 274 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3700  initiator RepB protein  25.93 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000306619  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  24.87 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  20.88 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  27.72 
 
 		 323 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  25 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  40.98 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0567  initiator RepB protein  21.16 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000593958  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  22.56 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  23.7 
 
 		 354 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1460  initiator RepB protein  23.77 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.805225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>