37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6574 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  945    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  47.46 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  48.99 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  37.53 
 
 		 471 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7550  hypothetical protein  33.63 
 
 		 468 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0539353 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  36.45 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  24.29 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  24.29 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  27.14 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  18.94 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  24.08 
 
 		 438 aa  54.7  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  24.82 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  24.08 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  23.77 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  24.1 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  20.88 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  25.79 
 
 		 438 aa  47  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  25.55 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  25.55 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  25.26 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  25.26 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  24.74 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  24.21 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  24.21 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  24.21 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  25.95 
 
 		 484 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  25.95 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  25.95 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  25.95 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  25.95 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  25.95 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  25.95 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  25.95 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  25.19 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  25.19 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  25.19 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  25.19 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>