41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4178 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  100 
 
 		 409 aa  848    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  34.98 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  36.32 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  29.49 
 
 		 381 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  28.44 
 
 		 315 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  34.38 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  27.47 
 
 		 230 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  28.57 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  26.72 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  27.95 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  24.26 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  26.64 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  27.62 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  27.62 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  25.94 
 
 		 324 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  24.69 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  27.11 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  26.15 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  25.76 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  25.83 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  26.23 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  26.38 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  25.62 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  26.58 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  27.32 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  27.32 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  24.5 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  24.88 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  26.16 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  27.32 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  25.84 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  22.62 
 
 		 336 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  22.35 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  25.47 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  22.52 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  22.1 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  22.1 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0015  replication initation protein Pi  24.4 
 
 		 290 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  22.33 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  22.33 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0120  PI protein  22.83 
 
 		 278 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157188  normal  0.651101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>