43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_p02 on replicon NC_006298
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006298  HS_p02  replication protein  100 
 
 		 323 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  73.68 
 
 		 323 aa  478  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  37.78 
 
 		 233 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  35.14 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  33.18 
 
 		 230 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  32.24 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  31.65 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  33.63 
 
 		 251 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  33.63 
 
 		 251 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  26.1 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  30.18 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  27.6 
 
 		 404 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  31.42 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  28.38 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  24.82 
 
 		 354 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  25.72 
 
 		 336 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  27.95 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  28.77 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  24.9 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  35.51 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  25 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  25.64 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  28.89 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  27.7 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  25.57 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  30.66 
 
 		 385 aa  57  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0015  replication initation protein Pi  25.21 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264408  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  32.26 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  23.23 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  26.53 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  30.58 
 
 		 223 aa  52.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  22.98 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  33.33 
 
 		 440 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  26.61 
 
 		 438 aa  49.7  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  27.21 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  26.61 
 
 		 438 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  28 
 
 		 429 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  27.27 
 
 		 433 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  24.34 
 
 		 438 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  24.34 
 
 		 438 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  24.34 
 
 		 438 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  24.64 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>