43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_p03 on replicon NC_006298
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006298  HS_p03  replication protein  100 
 
 		 323 aa  657    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  73.68 
 
 		 323 aa  477  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  38.39 
 
 		 233 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  38.81 
 
 		 230 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  36.04 
 
 		 219 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  32.56 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  31.51 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  30.63 
 
 		 251 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  30.63 
 
 		 251 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  29.09 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  25.37 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  29.05 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  33.04 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  26.81 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  26.28 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  26.84 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  26.67 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  26.52 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  31.16 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  24.9 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  24.22 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  22.78 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  24.1 
 
 		 443 aa  55.8  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  22.97 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  20.97 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  32.53 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  28.68 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  28.68 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  26.75 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  21.07 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  32 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  32 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  27.27 
 
 		 223 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  26.55 
 
 		 323 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  24.21 
 
 		 438 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  25.51 
 
 		 440 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  28.85 
 
 		 445 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  25.77 
 
 		 430 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3349  initiator RepB protein  29.46 
 
 		 398 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  22.69 
 
 		 438 aa  42.7  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>