25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_A06 on replicon NC_008503
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  100 
 
 		 386 aa  793    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  74.29 
 
 		 385 aa  592  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  73.45 
 
 		 388 aa  580  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  68.42 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  55.37 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  23.94 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  22.53 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  22.69 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  25.51 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  25.24 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  21.76 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  27.21 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  23.43 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  21.29 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  22.84 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  23.87 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  22.13 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  22.91 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  27.61 
 
 		 219 aa  53.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  22.35 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  20.25 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  27.48 
 
 		 320 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  25 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  31.07 
 
 		 223 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  23.32 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>