36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7050 on replicon NC_013736
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  100 
 
 		 331 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  66.05 
 
 		 324 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  32.62 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  27.51 
 
 		 383 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  27.23 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  25.5 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  34.15 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  24.91 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  26.07 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  31.88 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  31.25 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  27.61 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  36.3 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  29.76 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  25.79 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  24.6 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  27.15 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  28.68 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  22.94 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  27.98 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  29.66 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  29.66 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  25.83 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  28.9 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  31.85 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  30.92 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  23.43 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  25 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  34.23 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  25.71 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  23.16 
 
 		 440 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  32.43 
 
 		 445 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08250  replication protein  21.2 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0120  PI protein  27.93 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157188  normal  0.651101 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  26.82 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>