27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_E8 on replicon NC_008507
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  100 
 
 		 443 aa  909    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  69.51 
 
 		 385 aa  537  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  68.42 
 
 		 386 aa  528  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  64.52 
 
 		 388 aa  512  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  55.12 
 
 		 384 aa  415  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  27.55 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  29.66 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  30.41 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  31.25 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  23.2 
 
 		 354 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  25.73 
 
 		 342 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  25.91 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  31.49 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  26.42 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  26.23 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  25.11 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  29.77 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  22.86 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  23.53 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  26.51 
 
 		 320 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  25.93 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  26.36 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  23.55 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  25.45 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  25.88 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  18.68 
 
 		 274 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1460  initiator RepB protein  30.84 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.805225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>