32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6661 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  100 
 
 		 323 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  30.7 
 
 		 367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  24.91 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  29.59 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  27.73 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  27.23 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4227  initiator RepB protein  31.21 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0931296 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  26.42 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  26.89 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  23.38 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  25.28 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p01  hypothetical protein  30.71 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  24.29 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  22.96 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  25.51 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  30.09 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  26.22 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  28.19 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  26.17 
 
 		 233 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  24.07 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  26.05 
 
 		 230 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  28.32 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  24.44 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  23.35 
 
 		 440 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0022  truncated replication protein  25.73 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  27.72 
 
 		 399 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  23.23 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  27.87 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  20.73 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  26.96 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p09  hypothetical protein  30.99 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08250  replication protein  24.07 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>