39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5421 on replicon NC_010181
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  100 
 
 		 404 aa  811    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  41.8 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  40.87 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  49.09 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  36.32 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  29.68 
 
 		 230 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  29.33 
 
 		 308 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  29.44 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  27.57 
 
 		 219 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  27.91 
 
 		 323 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  27.8 
 
 		 251 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  27.8 
 
 		 251 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  30.88 
 
 		 233 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  29.28 
 
 		 319 aa  89.7  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  25.65 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  26.79 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  26.07 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  28.44 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  26.5 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  27.31 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  22.89 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  31.78 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  27.23 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  22.95 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  28.38 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  26.2 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  29.77 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  24.69 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p01  hypothetical protein  25.75 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08250  replication protein  25.62 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0015  replication initation protein Pi  33.57 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264408  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  24.62 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0022  truncated replication protein  32.5 
 
 		 214 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  27.78 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  24.89 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  24.42 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  23.7 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  24.17 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  27.5 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>