32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6850 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  100 
 
 		 367 aa  752    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  30.7 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  27.68 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  25.91 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  25 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  28.76 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  29.84 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  29.84 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  22.84 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  23.44 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  27.27 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  26.53 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  23.02 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  22.28 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  22.84 
 
 		 233 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  26.77 
 
 		 230 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  21.7 
 
 		 385 aa  53.1  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  25.71 
 
 		 331 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  28.03 
 
 		 320 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  27.78 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  27.08 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  23.11 
 
 		 323 aa  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  27.21 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  25.21 
 
 		 219 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  25.41 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  28.35 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A10  replication initiator protein  26.18 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00000639536  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  37.08 
 
 		 445 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  27.64 
 
 		 447 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  27.94 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  28.57 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08250  replication protein  22.95 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>