31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D23 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  100 
 
 		 384 aa  783    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  55.12 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  54.85 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  55.25 
 
 		 385 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  54.42 
 
 		 388 aa  391  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  32.89 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  31.21 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  31.78 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  24.49 
 
 		 324 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  21.8 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  24.6 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  24.5 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  23.22 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  25.62 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  30.37 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  31.2 
 
 		 315 aa  57  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  24.6 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  29.77 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  23.71 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  22.28 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  22.31 
 
 		 336 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  28.19 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  21.89 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  21.99 
 
 		 323 aa  50.4  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  27.34 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  29.36 
 
 		 223 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  40.98 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  22.44 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  22.44 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1460  initiator RepB protein  24.29 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.805225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3349  initiator RepB protein  31.4 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>