31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7066 on replicon NC_013738
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  100 
 
 		 308 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  32.27 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  32.62 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  28.66 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  29.33 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  28.26 
 
 		 383 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  27.6 
 
 		 381 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  26.07 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  29.59 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  26.52 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  25.54 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  25.15 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  27.94 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  27.11 
 
 		 409 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  22.61 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  26.53 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  22.33 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  22.27 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  25.51 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  25.51 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  34.55 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  21.85 
 
 		 388 aa  53.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p01  hypothetical protein  25.1 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  25.88 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08250  replication protein  21.46 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  27.34 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  20.66 
 
 		 219 aa  46.6  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  20.8 
 
 		 230 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  23.29 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  26.12 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  21.69 
 
 		 385 aa  42.7  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>