36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_A0036 on replicon NC_011148
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  100 
 
 		 354 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  38.67 
 
 		 342 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  34.55 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  29.79 
 
 		 219 aa  97.1  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  28.14 
 
 		 230 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  26.81 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  24.82 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  26.12 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  27.85 
 
 		 381 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  26.79 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  25.85 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  25.75 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  23.83 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  26.58 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  26.58 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  23.67 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  23.2 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  21.8 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  25 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  23.31 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  25.9 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  22.61 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0120  PI protein  25.31 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157188  normal  0.651101 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  24.31 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  25.51 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  25 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  22.4 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0001  hypothetical protein  36 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  26.43 
 
 		 419 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  29.49 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  28.93 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  28.93 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  27.55 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  21.29 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  27.94 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  23.7 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>