33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C16 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  100 
 
 		 388 aa  796    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  75.58 
 
 		 385 aa  593  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  73.45 
 
 		 386 aa  574  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  64.52 
 
 		 443 aa  512  1e-144  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  54.42 
 
 		 384 aa  391  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  26.12 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  28.29 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  22.89 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  25.87 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  26.14 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  25 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  26.89 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  27.15 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  29.85 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  30.5 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  24.49 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  26.58 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  24.69 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  23.44 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  21.3 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  22.8 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  29.01 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  21.85 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  23.46 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  24.39 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  28.16 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3334  hypothetical protein  41.07 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3349  initiator RepB protein  24.11 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  25 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1460  initiator RepB protein  29.25 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.805225  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  19.9 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  19.9 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  19.59 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>