37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0136 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  100 
 
 		 342 aa  705    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  38.67 
 
 		 354 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  40.53 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  28.57 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  27.8 
 
 		 219 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  29.51 
 
 		 383 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  26.1 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  28.99 
 
 		 230 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  25.42 
 
 		 233 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  29.27 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  25.44 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  25.79 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  25.79 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  26.5 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  28.29 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  25.73 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  24.26 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  25.51 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  24.5 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  29.46 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  28.9 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  26.09 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  24.26 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  34.55 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  22.32 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  25.68 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  22.22 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  29.93 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  25.28 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  25.41 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  23.53 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  22.13 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  45.28 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  45.28 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0001  hypothetical protein  33.85 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  26.96 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0120  PI protein  24.88 
 
 		 278 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157188  normal  0.651101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>