56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2493 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  100 
 
 		 315 aa  647    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  31.06 
 
 		 230 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  28.15 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  30.05 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  32.58 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  26.75 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  26.75 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  31 
 
 		 219 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  29.51 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  29.69 
 
 		 233 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  31.3 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  33.05 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  32.18 
 
 		 331 aa  95.5  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  24.05 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  28.44 
 
 		 409 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  26.91 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  27.59 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  24.58 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  28.25 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  24.68 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  25.32 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  31.18 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  24.67 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  29.61 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  26.67 
 
 		 440 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  29.82 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  26.18 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  26.18 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  30.66 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  26.01 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  22.27 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  30.1 
 
 		 399 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  29.17 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  24.5 
 
 		 386 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  24.29 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  26.05 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p01  hypothetical protein  26.28 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  29.11 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p09  hypothetical protein  29.41 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  25 
 
 		 455 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  27.89 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  31.68 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  30.3 
 
 		 419 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  27.36 
 
 		 438 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  27.36 
 
 		 438 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  27.36 
 
 		 438 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  27.36 
 
 		 438 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  27.36 
 
 		 438 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  27.36 
 
 		 438 aa  45.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  25.29 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  27.36 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0022  truncated replication protein  29.82 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0895  initiator RepB protein  25.18 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A10  replication initiator protein  27.78 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00000639536  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  26.97 
 
 		 390 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0120  PI protein  22.98 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157188  normal  0.651101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>