57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p43_01 on replicon NC_011316
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  63.06 
 
 		 230 aa  287  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  44.44 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  36.24 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  35.48 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  34.38 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  34.38 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  31.31 
 
 		 383 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  30.73 
 
 		 381 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  27.8 
 
 		 342 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  27.57 
 
 		 404 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  29.79 
 
 		 354 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  30.67 
 
 		 315 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  29.82 
 
 		 274 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  29.61 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  28.7 
 
 		 320 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  26.92 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  28.68 
 
 		 331 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  29.85 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  40.24 
 
 		 390 aa  62  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  40.24 
 
 		 430 aa  61.6  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  30.37 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  42.86 
 
 		 447 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  42.86 
 
 		 437 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  42.86 
 
 		 437 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  31.03 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  27.41 
 
 		 385 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  25.93 
 
 		 443 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  21.97 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  27.61 
 
 		 386 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0022  truncated replication protein  30.53 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  25.21 
 
 		 367 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  33.33 
 
 		 440 aa  48.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  32.53 
 
 		 433 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  24.55 
 
 		 438 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009713  CHAB381_A0002  putative RepE  29.25 
 
 		 376 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  25 
 
 		 438 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  20.66 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  23.23 
 
 		 323 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0120  PI protein  25.21 
 
 		 278 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157188  normal  0.651101 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  22.73 
 
 		 319 aa  45.4  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  35.23 
 
 		 313 aa  45.4  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  28.87 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  28.87 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  28.87 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3324  hypothetical protein  26.53 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.709661  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  28.87 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  28.87 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  28.87 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  28.87 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  27.08 
 
 		 320 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A10  replication initiator protein  19.44 
 
 		 296 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00000639536  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0015  replication initation protein Pi  27.74 
 
 		 290 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264408  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  29.67 
 
 		 429 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p01  hypothetical protein  29.89 
 
 		 303 aa  42  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  30.48 
 
 		 435 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  30.48 
 
 		 435 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>