41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7015 on replicon NC_013734
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  100 
 
 		 324 aa  670    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  66.05 
 
 		 331 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  28.66 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  30.67 
 
 		 383 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  31.14 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  28.27 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  25.49 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  30.41 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  26.21 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  26.14 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  27.31 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  27.73 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  25.43 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  24.49 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  26.72 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  26.9 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  25 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  25 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  26.9 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  25.83 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  28.76 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  22.12 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  28.89 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  28.14 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  24.02 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  26.09 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  23.87 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  23.23 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0120  PI protein  26.35 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157188  normal  0.651101 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  21.47 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  25.85 
 
 		 233 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  21.97 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  20.83 
 
 		 438 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  20.83 
 
 		 438 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4165  hypothetical protein  25.86 
 
 		 207 aa  52.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  25.62 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  28.68 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  22.91 
 
 		 433 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08250  replication protein  21.03 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  21.39 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  25.81 
 
 		 429 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>