69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3588 on replicon NC_013412
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  100 
 
 		 383 aa  779    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  75.32 
 
 		 381 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  42.09 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  43.5 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  35.48 
 
 		 230 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  34.96 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  31.19 
 
 		 219 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  32.24 
 
 		 323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  32.88 
 
 		 233 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  32.56 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  30.86 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  29.51 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  32.72 
 
 		 315 aa  103  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  27.56 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  27.56 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  28.26 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  24.7 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  28.42 
 
 		 443 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  28.51 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  25.23 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  32.69 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  25.75 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  27.69 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  25.94 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  27.78 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  26.23 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  24.89 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  23.05 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  25 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  25.7 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  28.26 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  28.26 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0022  truncated replication protein  29.73 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  24.55 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  21.25 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0895  initiator RepB protein  21.46 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  55.32 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  28.24 
 
 		 483 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  28.24 
 
 		 483 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  28.24 
 
 		 458 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  28.24 
 
 		 458 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  28.24 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  28.24 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  28.24 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  27.61 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  27.61 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  28.24 
 
 		 484 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0794  replication initiation and membrane attachment family protein  52 
 
 		 461 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  28.24 
 
 		 449 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08250  replication protein  22 
 
 		 358 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0120  PI protein  22.13 
 
 		 278 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157188  normal  0.651101 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  28.24 
 
 		 454 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  28.24 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  28.24 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  28.24 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  28.24 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  28.24 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  28.24 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  28.24 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  28.24 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  24.88 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  23.53 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  23.53 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  29.73 
 
 		 438 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  29.73 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  29.73 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  25 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  25.65 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  24.81 
 
 		 447 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>