15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0120 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0120  PI protein  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157188  normal  0.651101 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0015  replication initation protein Pi  35.19 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264408  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  25.31 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  26.35 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  23.97 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  22.05 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  25.21 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  22.05 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  26.06 
 
 		 383 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  22.83 
 
 		 409 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  24.64 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  27.93 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  22.98 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  22.36 
 
 		 385 aa  43.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  24.88 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>