59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3494 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  100 
 
 		 437 aa  888    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  100 
 
 		 437 aa  888    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  91.53 
 
 		 447 aa  799    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  63.21 
 
 		 430 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  65.77 
 
 		 390 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  42.56 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  36.25 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  36.25 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  37.13 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  30.53 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  30.53 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  30.14 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  29.33 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  29.33 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  29.33 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  29.57 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  26.88 
 
 		 399 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  28.67 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  28.66 
 
 		 460 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  28.78 
 
 		 449 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  28.03 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  28.03 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  28.03 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  28.03 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  28.03 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  28.44 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  28.86 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  28.61 
 
 		 484 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  28.86 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  28.86 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  28.03 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  28.03 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  28.08 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  28.34 
 
 		 454 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  28.34 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  25.77 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  27.04 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  29.3 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  22.99 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  25.64 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  23.96 
 
 		 440 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  23.17 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  41.3 
 
 		 230 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  26.53 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  29.76 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  25.97 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  25.99 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  24.7 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  42.86 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  30.53 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  38.96 
 
 		 274 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  30.54 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  22.84 
 
 		 488 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  23.19 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  25.55 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  24.4 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>