42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4694 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  100 
 
 		 476 aa  968    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  28.49 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  27.45 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  27.45 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  27.76 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  27.76 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  27.76 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  27.76 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  27.76 
 
 		 487 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  27.84 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  27.84 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  27.84 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  27.84 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  27.84 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  27.84 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  27.84 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  27.84 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  27.3 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  27.3 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  27.3 
 
 		 449 aa  100  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  24.78 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  21.29 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  21.29 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  22.05 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  22.59 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  22.29 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  22.29 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  22.29 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  22.12 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  22.12 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  21.39 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  24.7 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  24.7 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  24.7 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  25 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  24 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  23.12 
 
 		 433 aa  53.9  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  24.88 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  21.59 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  19.75 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  22.22 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  25.1 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>