49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5513 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  100 
 
 		 431 aa  885    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  51.16 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  40.09 
 
 		 440 aa  342  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  37.01 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  37.01 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  37.01 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  36.21 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  36.17 
 
 		 438 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  36.17 
 
 		 438 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  35.98 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  34.04 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  34.04 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  26.27 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  27.04 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  26.81 
 
 		 449 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  27.08 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  26.33 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  26.85 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  26.85 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  26.79 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  26.62 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  26.62 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  26.62 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  25.46 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  25.46 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  25.46 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  25.46 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  25.46 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  25.46 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  25.46 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  24.94 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  24.35 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  26.71 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  26.37 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  27.93 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  23.62 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  24.1 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  24.65 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  24.35 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  24.02 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  24.02 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  24.24 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  19.89 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  23.93 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  25.75 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  19.75 
 
 		 476 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  25.28 
 
 		 342 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  19.31 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  24.16 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>