57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0083 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  907    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  40.09 
 
 		 431 aa  342  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  38.21 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  34.24 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  34.47 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  34.47 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  34.62 
 
 		 438 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  34.62 
 
 		 438 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  34.62 
 
 		 438 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  34.39 
 
 		 438 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  34.4 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  34.4 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  32.08 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  28.68 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  31.85 
 
 		 455 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  31.85 
 
 		 455 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  31.85 
 
 		 455 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  31.62 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  30.16 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  30.63 
 
 		 483 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  30.63 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  30.16 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  30.16 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  30.63 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  30.63 
 
 		 483 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  30.44 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  30.66 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  30.9 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  30.44 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  29.86 
 
 		 484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  31.29 
 
 		 449 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  31.4 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  29 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  30.55 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  30.55 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  26.79 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  29.23 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  28.63 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  28.06 
 
 		 438 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  26.5 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  29.13 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  25.57 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  24.82 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  24.35 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  22.65 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  24.86 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  24.1 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  25.53 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  24.5 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  26.92 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  25.16 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  21.47 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  23.16 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  22.5 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  21.59 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  23.35 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  20.59 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>