41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4356 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1040    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  56.2 
 
 		 488 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  24.82 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  24.06 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  24.06 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  27.17 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  27.17 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  27.17 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  27.17 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  27.17 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  27.17 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  27.17 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  27.17 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  26.79 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  26.79 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  26.79 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  23.57 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  24.82 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  23.57 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  23.57 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  26.79 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  26.79 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  26.79 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  24 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  23.97 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  24 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  24.27 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  25.36 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  26.09 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  26.09 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  26.09 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  23.74 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  24.71 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  25.75 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  23.66 
 
 		 429 aa  54.3  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  24.62 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  24.88 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  19.32 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  24.58 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  19.96 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  22.56 
 
 		 399 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>