52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4153 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  88.21 
 
 
483 aa  815    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  89.38 
 
 
455 aa  824    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  90.11 
 
 
454 aa  824    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  90.33 
 
 
454 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  88.21 
 
 
458 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  88.12 
 
 
446 aa  800    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  88.12 
 
 
446 aa  800    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  88.21 
 
 
458 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  88.12 
 
 
446 aa  800    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  100 
 
 
449 aa  915    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  93.99 
 
 
449 aa  866    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  89.38 
 
 
455 aa  824    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  90.33 
 
 
487 aa  827    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  89.38 
 
 
455 aa  824    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  94.43 
 
 
460 aa  871    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  88.21 
 
 
483 aa  815    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  89.38 
 
 
455 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  88.24 
 
 
484 aa  813    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  39.42 
 
 
457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  31.97 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  31.97 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  33.79 
 
 
438 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  32.88 
 
 
438 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  33.56 
 
 
438 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  33.56 
 
 
438 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  31.74 
 
 
419 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  31.29 
 
 
440 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  31.14 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  26.81 
 
 
431 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  26.81 
 
 
433 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  29.89 
 
 
447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  29.25 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  28.57 
 
 
437 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  28.57 
 
 
437 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  29.27 
 
 
430 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  27.3 
 
 
476 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  26.79 
 
 
429 aa  93.6  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  27.05 
 
 
438 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  26.64 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  27.56 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  26.51 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  24.93 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  26.09 
 
 
505 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  29.08 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  23.42 
 
 
412 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  23.82 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  25.2 
 
 
340 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  28.12 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  25.32 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>