59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1510 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  897    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  100 
 
 		 435 aa  897    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  47.95 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  47.84 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  47.84 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  47.26 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  47.26 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  47.26 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  47.61 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  34.04 
 
 		 431 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  34.4 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  34.2 
 
 		 433 aa  250  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  31.97 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  31.46 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  31.32 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  31.46 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  31.32 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  31.46 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  31.46 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  31.24 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  31.63 
 
 		 483 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  31.63 
 
 		 483 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  31.63 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  31.24 
 
 		 449 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  31.63 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  31.63 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  31.63 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  31.63 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  31.33 
 
 		 484 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  31.24 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  30.02 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  31.23 
 
 		 447 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  30.96 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  30.53 
 
 		 437 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  30.53 
 
 		 437 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  34.22 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  30.2 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  28.37 
 
 		 399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  30.2 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  30.4 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  24.48 
 
 		 457 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  27.82 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  23.1 
 
 		 455 aa  96.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  24 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  23.15 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  25 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  24.53 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  21.29 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  20.36 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  24.29 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  27.15 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  26.18 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  23.31 
 
 		 340 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  23.64 
 
 		 313 aa  48.5  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  22.06 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  32 
 
 		 323 aa  44.3  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  27.04 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  33.72 
 
 		 233 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  45.28 
 
 		 342 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>