29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1802 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  28.57 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  29.95 
 
 
430 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  28.44 
 
 
438 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  28.99 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  22.86 
 
 
399 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  27.49 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  30.05 
 
 
447 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  30.54 
 
 
437 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  35.63 
 
 
223 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  24.81 
 
 
438 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  24.81 
 
 
438 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  30.54 
 
 
437 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  24.81 
 
 
438 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  24.81 
 
 
438 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  24.81 
 
 
438 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  24.81 
 
 
438 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  24.81 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  27.47 
 
 
429 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  26.38 
 
 
433 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  23.64 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  23.64 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  35.23 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  24.89 
 
 
457 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  23.45 
 
 
449 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  23.45 
 
 
460 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  22.47 
 
 
455 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  22.47 
 
 
455 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  22.47 
 
 
455 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>