20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3552 on replicon NC_011367
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  41.05 
 
 		 340 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  30.46 
 
 		 371 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  31.62 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  29.71 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  32.48 
 
 		 438 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  32.48 
 
 		 438 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  35.63 
 
 		 313 aa  52  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  31.4 
 
 		 323 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  30.25 
 
 		 390 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  31.07 
 
 		 386 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  30.33 
 
 		 430 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  28.36 
 
 		 385 aa  47.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  29.36 
 
 		 384 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  28.16 
 
 		 388 aa  45.8  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  21.52 
 
 		 440 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  26.74 
 
 		 323 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  26.29 
 
 		 443 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  26.21 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  25.15 
 
 		 433 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>