53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7009 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  88.86 
 
 		 483 aa  818    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  90.09 
 
 		 454 aa  828    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  90.27 
 
 		 455 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  90.75 
 
 		 454 aa  837    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  88.86 
 
 		 458 aa  818    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  88.79 
 
 		 446 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  88.79 
 
 		 446 aa  803    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  88.86 
 
 		 458 aa  818    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  88.79 
 
 		 446 aa  803    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  93.99 
 
 		 449 aa  866    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  100 
 
 		 449 aa  914    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  90.27 
 
 		 455 aa  832    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  90.75 
 
 		 487 aa  836    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  90.27 
 
 		 455 aa  832    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  88.86 
 
 		 483 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  98.89 
 
 		 460 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  90.04 
 
 		 455 aa  830    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  88.89 
 
 		 484 aa  813    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  39.56 
 
 		 457 aa  288  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  33.72 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  34.32 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  34.1 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  34.1 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  34.1 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  34.09 
 
 		 438 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  34.09 
 
 		 438 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  31.24 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  31.24 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5084  initiator RepB protein  31.51 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192161 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  30.9 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0080  hypothetical protein  30.54 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00491094 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5513  initiator RepB protein  27.04 
 
 		 431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  26.23 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  28.54 
 
 		 447 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  28.7 
 
 		 390 aa  113  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  28.66 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  28.66 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  29.67 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4694  initiator RepB protein  27.3 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.251303  normal  0.0571299 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  26.55 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  27.05 
 
 		 438 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  26.64 
 
 		 438 aa  86.7  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  28.46 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4998  hypothetical protein  25.35 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  26.21 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4356  hypothetical protein  26.09 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  28.67 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  23.57 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  22.54 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  25.42 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  28.12 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  25.32 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1802  hypothetical protein  23.45 
 
 		 313 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>