43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4938 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  100 
 
 		 471 aa  973    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  39.1 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  39.95 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  38.23 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7550  hypothetical protein  35.48 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0539353 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  33.82 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  22 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  20.27 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  21.13 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  23.18 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  24.86 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  22.77 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3026  putative replication protein  23.41 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  22.74 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  22.77 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7009  putative replication protein  23.46 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.643395  normal  0.034808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4153  putative replication protein  23.36 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  21.55 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0003  hypothetical protein  24.19 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3160  hypothetical protein  23.36 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1145  putative plasmid replication protein  22.32 
 
 		 446 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3178  putative replication protein  22.32 
 
 		 446 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.29665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3291  replication protein  22.32 
 
 		 446 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0254178  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2117  putative plasmid replication protein  22.32 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0976638  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2412  putative replication protein  22.32 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1425  putative plasmid replication protein  22.32 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1505  plasmid replication protein, putative  22.32 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5164  hypothetical protein  23.36 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5695  hypothetical protein  23.36 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18908  hitchhiker  0.00131536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4541  hypothetical protein  23.36 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0840872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2373  plasmid replication protein, putative  23.36 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0755761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3108  hypothetical protein  22.94 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754423  normal  0.245569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4967  hypothetical protein  26.4 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131096  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  19.79 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  25.39 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4244  initiator RepB protein  24.9 
 
 		 433 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  20.52 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  20.43 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  20.52 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  21.98 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  21.98 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  20.52 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  22.08 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>