16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7550 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7550  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  972    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0539353 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  40.09 
 
 
468 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  38.33 
 
 
467 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  33.63 
 
 
465 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  34.71 
 
 
471 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  30 
 
 
445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  23.63 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  24.8 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  24.8 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  22.18 
 
 
438 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  22.18 
 
 
438 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  22.18 
 
 
438 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  24.9 
 
 
438 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  22.4 
 
 
438 aa  53.5  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  23.93 
 
 
438 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  23.93 
 
 
438 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>