25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6161 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  963    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  78.23 
 
 		 467 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  47.46 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7550  hypothetical protein  40.09 
 
 		 468 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0539353 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  38.82 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  35.51 
 
 		 445 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  21.47 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  20.79 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  20.79 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  22.57 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  25.09 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  25.68 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  25.09 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  24.59 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  25.61 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  25.61 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  25.61 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  25.61 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  28.06 
 
 		 390 aa  53.5  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  26.18 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  26.18 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  25.59 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  24.02 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  24.02 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  20.59 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>