26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1368 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6161  hypothetical protein  78.23 
 
 		 468 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1368  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  960    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6574  hypothetical protein  48.99 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.478836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7550  hypothetical protein  38.33 
 
 		 468 aa  326  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0539353 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4938  initiator RepB protein  39.72 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  0.519061 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6060  plasmid replication protein  36.76 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  20.66 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  21.24 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  21.24 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  22.94 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  25.82 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  20.86 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  20.59 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  20.59 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  20.82 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  20.59 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1510  hypothetical protein  27.15 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.446382 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5175  replication protein  27.15 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  20.43 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  20.43 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  25.45 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  24.77 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  24.77 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  27.34 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0083  hypothetical protein  22.5 
 
 		 440 aa  50.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.690392  hitchhiker  0.00257174 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2773  hypothetical protein  26.55 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>