17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_7051 on replicon NC_013737
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  100 
 
 		 320 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  32.27 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  25.49 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  25.5 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  27.78 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  27.6 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  28.38 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  24.6 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  24.89 
 
 		 438 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  24.44 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009713  CHAB381_A0002  putative RepE  24.63 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  29.1 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  27.89 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  24.82 
 
 		 233 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  27.61 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  24.68 
 
 		 429 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  27.08 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>