25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1364 on replicon NC_009796
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  100 
 
 		 319 aa  638    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  29.28 
 
 		 404 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  31.02 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  28.7 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  26.15 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  28.77 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  24.12 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  25.21 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  27.94 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  22.94 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  22.12 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  25.43 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  23.87 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  23.42 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  25.45 
 
 		 443 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  22.22 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  22.92 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  22.92 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  24.39 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  27.15 
 
 		 385 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  24.44 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  22.17 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  22.73 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  22.58 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  21.29 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>