36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_A0001 on replicon NC_011351
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  100 
 
 		 336 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  40.53 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  34.55 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  31.17 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  30.42 
 
 		 233 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  26.28 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  28.51 
 
 		 383 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  29.61 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  25.72 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  28.1 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  24.03 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  24.26 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  24.26 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  22.69 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  24.02 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  24.69 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  22.33 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  23.53 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  34.23 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  23.11 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  23.02 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  22.31 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  28.32 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  25.22 
 
 		 320 aa  46.2  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7739  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.629134 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6195  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204681 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  22.58 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5756  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693457  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6162  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.026814 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  29.06 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  22.03 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  29.92 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  19.59 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>