11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08250 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08250  replication protein  100 
 
 		 358 aa  735    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4227  initiator RepB protein  32.2 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0931296 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  25.62 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  21.03 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  21.46 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  22 
 
 		 383 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  21.2 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  23.5 
 
 		 230 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  22.03 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  22.95 
 
 		 367 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  24.07 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>