37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0315 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  100 
 
 		 320 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  49.09 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  43.78 
 
 		 381 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  44.24 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  31.42 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  30.18 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  29.05 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  26.07 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  28.7 
 
 		 219 aa  86.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  34.38 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  31.02 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  26.18 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  26.18 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  25.66 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  25.81 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  25.22 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  27.61 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  26.72 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7051  initiator RepB protein  24.6 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6661  initiator RepB protein  23.38 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.486631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  24.26 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  29.01 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  29.77 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  26.51 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B6  replication initiator protein  29.01 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  29.29 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  22.4 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6850  initiator RepB protein  28.03 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0436746  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3700  initiator RepB protein  39.39 
 
 		 403 aa  52.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000306619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3324  hypothetical protein  26.06 
 
 		 393 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.709661  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7035  initiator RepB protein  28.86 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  27.48 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  23.5 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0895  initiator RepB protein  21.95 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  25.22 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3349  initiator RepB protein  24.65 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0567  initiator RepB protein  25.28 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000593958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>